MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Aklavik117 chromosome

Total Repeats: 3331

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019560	TTTTA	2	10	2428	2437	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019560	GGT	2	6	4085	4090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019560	TAT	2	6	4133	4138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019560	TGG	2	6	4177	4182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019560	TGG	2	6	4290	4295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019560	GTG	2	6	4406	4411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019560	ACC	2	6	4438	4443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_019560	GGT	2	6	4451	4456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019560	A	7	7	4572	4578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019560	T	8	8	4592	4599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019560	AAT	2	6	4613	4618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019560	GAAAC	2	10	4642	4651	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_019560	TAAA	2	8	4682	4689	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019560	A	6	6	4687	4692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019560	ATT	2	6	4808	4813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019560	T	7	7	4826	4832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019560	A	6	6	4837	4842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019560	A	6	6	4853	4858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019560	TGT	2	6	4892	4897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019560	C	7	7	4978	4984	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
21	NC_019560	A	6	6	4985	4990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019560	A	7	7	4999	5005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019560	TGT	2	6	7179	7184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019560	A	14	14	7188	7201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019560	ATT	2	6	7230	7235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019560	G	6	6	7240	7245	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019560	TGT	2	6	7266	7271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019560	CAAA	2	8	7302	7309	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_019560	TCA	2	6	7330	7335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_019560	AGA	2	6	7341	7346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019560	TAA	2	6	9011	9016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019560	TAA	2	6	9490	9495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019560	ATT	2	6	9509	9514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019560	TTA	2	6	9573	9578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019560	TATT	2	8	9600	9607	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019560	ATTC	2	8	9615	9622	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_019560	ACA	2	6	9632	9637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_019560	GAA	2	6	9650	9655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019560	T	6	6	12402	12407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019560	T	6	6	12469	12474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019560	AGG	2	6	12475	12480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019560	GCTTT	2	10	13333	13342	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_019560	T	6	6	13340	13345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019560	AC	3	6	13363	13368	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_019560	T	7	7	13402	13408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019560	ATA	2	6	13412	13417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019560	TTAA	2	8	13431	13438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019560	AGTT	2	8	16377	16384	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019560	CA	3	6	16438	16443	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_019560	CTG	2	6	16459	16464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019560	A	7	7	16594	16600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019560	A	6	6	18034	18039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019560	AAACAC	2	12	18069	18080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_019560	ATCA	2	8	22472	22479	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_019560	GTTG	2	8	22572	22579	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019560	GGCAT	2	10	22625	22634	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_019560	TTTCTT	2	12	22690	22701	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_019560	TGA	2	6	22735	22740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019560	AAG	2	6	22760	22765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019560	CTT	2	6	24939	24944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_019560	GATT	2	8	24952	24959	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019560	GT	3	6	24981	24986	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019560	TAAG	2	8	24990	24997	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019560	TAATA	2	10	25018	25027	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019560	A	18	18	25073	25090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019560	GTT	2	6	25164	25169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019560	A	6	6	25187	25192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019560	AG	3	6	25283	25288	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019560	T	6	6	25303	25308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019560	TTTG	2	8	25365	25372	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019560	TCGC	2	8	25388	25395	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_019560	A	6	6	26812	26817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019560	T	6	6	26847	26852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019560	A	6	6	26890	26895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019560	GTA	2	6	26912	26917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019560	T	6	6	28249	28254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019560	A	6	6	28281	28286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019560	GGTT	2	8	29860	29867	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019560	AGC	2	6	30309	30314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_019560	TAA	2	6	38499	38504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019560	A	7	7	38509	38515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019560	GAT	2	6	42099	42104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019560	ATTTT	2	10	42181	42190	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019560	T	6	6	49491	49496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019560	CT	3	6	49586	49591	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_019560	A	6	6	49609	49614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019560	GA	3	6	49663	49668	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019560	CAT	2	6	49766	49771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_019560	T	6	6	49835	49840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019560	AAG	2	6	51830	51835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019560	TTGA	2	8	51841	51848	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019560	CAA	2	6	51859	51864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_019560	CAA	2	6	51913	51918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_019560	T	6	6	51929	51934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019560	TTTA	2	8	57205	57212	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019560	GCGG	2	8	57243	57250	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
97	NC_019560	T	6	6	57276	57281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019560	GGT	2	6	57300	57305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019560	AATT	2	8	57306	57313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019560	TTGT	2	8	57383	57390	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019560	TAA	3	9	57411	57419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019560	TTAAA	2	10	57474	57483	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019560	A	6	6	57494	57499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019560	G	8	8	57754	57761	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019560	A	7	7	57763	57769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019560	TCA	2	6	63463	63468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_019560	A	6	6	63468	63473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019560	AAAGAG	2	12	63525	63536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019560	GC	3	6	63551	63556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_019560	GTG	2	6	63600	63605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019560	TGA	2	6	63622	63627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019560	ACA	2	6	63649	63654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_019560	GAT	2	6	63918	63923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019560	AGA	2	6	63949	63954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019560	CAAA	2	8	63958	63965	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_019560	AAG	2	6	64002	64007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019560	CG	3	6	64045	64050	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_019560	TAG	2	6	64059	64064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019560	A	6	6	64121	64126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019560	GTT	2	6	64151	64156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019560	GA	3	6	64258	64263	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019560	A	6	6	64282	64287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019560	TCTAC	2	10	64317	64326	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
124	NC_019560	AG	3	6	64336	64341	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019560	GGA	2	6	64354	64359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019560	GATA	2	8	64447	64454	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019560	AATAT	2	10	64458	64467	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019560	A	7	7	64529	64535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019560	TGA	2	6	64543	64548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019560	CTT	2	6	64581	64586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_019560	TGA	2	6	64662	64667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019560	GCG	2	6	64668	64673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_019560	TGA	2	6	64684	64689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019560	ATTTG	2	10	64832	64841	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019560	GCG	2	6	64846	64851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_019560	TGA	2	6	64862	64867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019560	A	6	6	64927	64932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019560	A	6	6	64935	64940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019560	AGAA	2	8	64997	65004	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019560	ATG	2	6	65011	65016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019560	GAAA	2	8	65033	65040	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019560	CTT	2	6	65047	65052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_019560	AAGAT	2	10	65068	65077	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019560	CAT	2	6	65114	65119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_019560	AG	3	6	65127	65132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019560	GAA	2	6	65202	65207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019560	AG	3	6	65229	65234	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019560	CTT	2	6	65287	65292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_019560	ATG	2	6	65293	65298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_019560	A	6	6	65365	65370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_019560	TAA	2	6	65405	65410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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442	NC_019560	TGA	2	6	188549	188554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
443	NC_019560	GAG	2	6	188604	188609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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464	NC_019560	A	6	6	195231	195236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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475	NC_019560	TAA	2	6	198046	198051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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